Отражение Сф Исправление по НДС

Добрый день! Вынуждена снова вернуться к вопросу правильности отражения нами (Покупателем) СФ Исправление от поставщика. Ситуация такова, что 24.09.18 мы получаем Сф с неверными ценами. На момент сдачи декларации по НДС за 3 квартал КСФ нам Поставщик не передал. Мы приняли к вычету полную стоимость. Позже поставщик передает к этой поставке СФ Исправление, которая датируется 15.10.18г. Отражая ее в 1С, мы получили картину, что база НДС за 3 кв. уменьшилась на полную сумму НДС поставки 24.09.18, а Исправление отразилось в 4 квартале 15.10.18. Как следствие, сумма НДС к уплате в 4 квартале увеличилась на всю сумму НДС проблемной поставки. Т.к. была сдана уточняющая декларация в феврале 2019г, то в результате перерасчета сумм, подлежащих оплате в окт, нояб, дек, выплыла недоимка, на которую ФНС насчитали штраф в размере 20%.
Нашей вины в данной ситуации нет:
1) мы отразили НДС в 3 квартале на основании реального СФ, который почему-то поставщик не отразил.
2) СФ Исправление была выписана спустя 21 день с момента поставки, на это мы тоже повлиять не можем.
3) Правомерно ли исправление неверной цены делать не через Корректировочный СФ, а именно через Исправление?
4) Верно ли мы отразили СФ Исправление, в результате чего у нас данные по перерасчету НДС легли в разные кварталы, что привело к доначислению нам штрафных санкций?
Подскажите, пожалуйста, как поступить, чтобы избежать штрафа и нежелательной репутации.