Отчетность по сотруднику филиала.

Добрый день! У бухгалтеров нашего учреждения возникло много вопросов по данной теме. Помогите, пожалуйста, разобраться.
Сотруднику филиала (филиал самостоятельно делает выплаты сотрудникам, сдает отчетность, у филиала КПП и ОКТМО отличаются от КПП и ОКТМО головной организации, т.е. нашего учреждения). Этому сотруднику нужно выплатить вознаграждение за научное изобретение (патент) из средств от приносящей доход деятельности. Филиал не занимается деятельностью, приносящей доход. Финансирование только из бюджета. Как выплатить вознаграждение за патент и как и кто должен сдавать по нему отчетность?