Исправление отпуска

Добрый день.
Ситуация такая — Сотрудник основной работает еще в временном подразделении как совместитель.
Зарплата рассчитывается отдельно по основному сотруднику и по временному подразделению (расчет зп по подразделению)
Сотрудник идет в отпуск по основному подразделению, в следующем месяце делаем исправление отпуска, перерасчет среднего.
Почему в регистры делаются записи по ндфл по обоим подразделениям?
Потом в ведомостях происходит путаница с ндфл по основному и временному подразделению.
Понятно что ндфл расчитывается по физ лицу.
Как это можно обойти?