Больничный лист

Добрый день. Сотрудник находился на больничных с мая по сентябрь. За период с января по май доход составил 34267,75, вычеты на детей 14000 (ежемесячная сумма вычета на двоих детей 2800) , итого ндфл удержан в размере 2635. В сентябре сотрудник увольняется, программа считает вычеты за месяцы , когда сотрудник был на больничном — за июнь, июль, август (2800*3) . Мы должны за период отсутствия сотрудника принимать вычеты? должны доплатить?