НДС раздельный учет

ВОПРОС Организация-застройщик-заказчик построила жилой дом, в котором есть квартиры (85 % от общей площади) и нежилые помещения (15 % от общей площади), иной деятельности в периоде строительства Организация не осуществляла. Строительство примерно 60% квартир осуществлялось в рамках договоров ДДУ, остальные 40 % предназначены для реализации. Таким образом, организация осуществляет облагаемую и необлагаемую НДС деятельность.
Суммы НДС, предъявленные подрядчиками и поставщиками материалов при строительстве жилого дома, Организация отражала в учете по способу учету НДС- «распределяется».
После завершения строительства и принятия застройщиком на учет жилого дома Организацией проведен расчет (в excel) суммы НДС, принимаемой к вычету в части площади нежилых помещений и суммы НДС, учитываемой в стоимости квартир, пропорционально площади нежилых помещений и площади квартир в общей площади возводимого дома. Есть судебные решения, подтверждающие правомерность такого расчета (Постановления ФАС Московского округа от 26.04.2012 N А40-103560/11-129-440, ФАС Северо-Кавказского округа от 15.03.2012 N А53-6860/2011).
Организация применяет основную систему налогообложения, ведет учет в программе 1С, Бухгалтерия предприятия, редакция 3.0 (3.0.183.24). За период строительства от поставщиков и подрядчиков получено более 1000 счетов-фактур и УПД.
Есть ли возможность настроить программу таким образом, чтобы НДС, который следует отнести к необлагаемой НДС деятельности, был автоматически рассчитан пропорционально площади и отнесен на стоимость квартир? А суммы НДС по работам и услугам, в части приходящейся на строительство нежилых помещений были отражены в книге покупок. Если нет такой возможности применяемой программы, то как можно минимизировать трудозатраты в данном случае при распределении НДС на облагаемую и необлагаемую деятельность.
Приобретение специализированной программы для строительства не рассматривается.
Суммы НДС, предъявленные подрядчиками организации-застройщику при строительстве дома, относятся к деятельности по реализации как жилых, так и нежилых помещений в этом доме. Следовательно, организация-застройщик вправе принять к вычету НДС, предъявленный подрядчиками, в части, относящейся к деятельности по реализации нежилых помещений.